Водоотведение г. Кумертау представляет собой сложный комплекс инженерных сооружений и технологических процессов, конечной целью которых является обеспечение экологической безопасности системы водоотведения и очистки стоков.
Отводимые канализационные стоки по самотечным коллекторам поступают на главную канализационную насосную станцию, далее по напорным коллекторам перекачиваются на биологические очистные сооружения (БОС) производительностью 25 тысяч кубических метров в сутки.
Принятые стоки на очистных сооружениях проходят многоступенчатую очистку до норматива допустимого сброса. Контроль качества сбрасываемых стоков производится аккредитованной лабораторией предприятия.
Протяженность канализационных сетей составляет 95 км. в т.ч. напорные коллектора — 21,7 км.
Республиканской целевой программой «Обеспечение населения Республики Башкортостан питьевой водой предусмотрена реконструкция сети водоотведения и очистных сооружений города Кумертау.